Les Peptides

 

I.    Généralités

    1.    Définition

        Les peptides sont des composés synthétiques ou naturels résultant de l’enchaînement limité d’acides aminés unis entre eux par des liaisons peptidiques entre
–alpha.png (143 octets)COOH du groupement fonctionnel et
–alpha.png (143 octets)NH2 du groupement fonctionnel de l’acide aminé qui suit.

         Par convention, on lit une séquence avec
Le premier acide aminé porte –alpha.png (143 octets)NH2 libre
Le dernier porte –alpha.png (143 octets)COOH libre

        Différents peptides
Oligopeptides : nombre d’acides aminés < 10
Polypeptides : 10 < nombre d’acides aminés < 100

    2.    Nomenclature

Ala-Gly-Val Alanyl-Glycyl-Valine

II.    Configuration des peptides

    1.    La liaison peptidique

        Configurations Etude d'une chaîne peptidiqueLa liaison peptidique
Configuration plane
Configuration spatiale

    2.    Association de liaisons peptidiques   Conformations spatiales

        Empêchements stériques

        Formation de ponts hydrogène pour stabiliser la structure

        Les radicaux –R dans un enchaînement peptidique ont une importance considérable par leur caractère hydrophobe ou hydrophile

III.    Etude de la composition d’un peptide et d’une protéine

    1.    Détermination de la masse molaire

        Méthode cryoscopique
Pour les très petits peptides

        Méthode chimique
Dosage de l’acide aminé en plus faible quantité dans le peptide
Ou au minimum d’un résidu

    2.    La nature et le nombre d’acides aminés présents

        Hydrolyse totale par HCl à 6 mol/L
Destruction des liaisons peptidiques
Trp détruit ; Asn à Asp ; Gln à Glu

        Identification et dosage des acides aminés libérés
Chromatographie échangeuse d’ions HPLC

    3.    Etude de la séquence Identification de l'acide aminé N-terminal d'une chaîne peptidique Identification de l'acide aminé C-terminal d'une chaîne peptidique

Méthodes Identification N-terminal Identification C-terminal
Méthode chimique Méthode de Sanger (FluoroDiNitroBenzène FDNTB) Hydrazinolyse
Méthode chimique Méthode d’Edman (PhénylIsoThioCyanate PITC)
Méthode enzymatique Aminopeptidase Carboxypeptidase
Hydrolyse partielle

Trypsine : AA1 = Lys / Arg
Chymyotrypsine : AA1 = Phe / Trp / Tyr
Pepsine : AA2 = Phe / Trp / Tyr
Thermolysine : AA2 = Leu / Ile / Val

IV.    Exemples de quelques peptides

Représentation de quelques peptides

    1.    Petits peptides

        Aspartame
Asp-Phe-O-CH3
Pouvoir sucrant 2x plus que le saccharose

        Glucation
g-Glu-Cys-Gly 2G-SH -> G-S-S-G + 2H+ + 2e-

    2.    Peptides hormonaux

        Hormones post-hypophysaires
Ocytocine
Vasopressine

        Hormones pancréatiques
Glucagon
Insuline [Voir la molécule] [Autre vue]

    3.    Peptides antibiotiques

Tyrocidine A
Pénicillines

V.    Synthèse chimique des peptides

    1.    Méthode en phase solide de Merrifield Synthèse peptidique automatisée par la méthode en phase solide de Merrifield

        Principe
Ancrage du peptide sur une résine
Fixation des acides aminés par leur –COOH activés
Protection des autres fonctions

        Intérêts
Vérifier la structure d’un peptide déterminé
Etudier l’effet de substitution d’un résidu acide aminé par un autre sur les propriétés biologiques du peptide
Synthèse de vaccins

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